博士后合作导师

李婧

中山大学肿瘤防治中心副研究员，博士生导师。本科（2009）和博士（2014）毕业于南京大学，2014-2019法国国家科学研究中心（CNRS）博士后。2019年入选中山大学“百人计划”，2022年入选广东省“珠江人才计划”，2024年入选中山大学肿瘤防治中心“优青提升计划”。长期从事遗传演化领域的研究，近期研究聚焦于细胞在内、外胁迫条件下的突变特征和分子机制。迄今共发表论文20余篇，近年来，以第一或通讯作者身份（含共同）在Molecular Biology and Evolution、Nucleic Acids Research、PNAS、PLOS Genetics等国际著名期刊上发表多项代表性工作。近期主持的研究项目获得了国家自然科学基金委员会、广东省自然科学基金委员会、广州市科技局、中山大学和中山大学肿瘤防治中心的资助。担任Journal of Genetics and Genomics期刊青年编委。

研究方向：

  1. 肺癌化疗和靶向治疗的耐药演化和机制
  2. 抗肿瘤治疗的突变印记和机制
  3. 非整倍体的基因组不稳定性

代表性论文（*通讯作者，#第一作者）：

  1. Zepu Miao#, Yifan Ren#, Andrea Tarabini#, Ludong Yang, Huihui Li, Chang Ye, Gianni Liti, Gilles Fischer, Jing Li*, Jia-Xing Yue* (2024) ScRAPdb, an integrated pan-omics database for the Saccharomyces cerevisiae reference assembly panel. Nucleic Acids Research (in press; doi: 10.1093/nar/gkae955).
  2. Ludong Yang#, Xinxin Zhang#, Fan Wang#, Li Zhang*, Jing Li*, Jia-Xing Yue*. (2024) NanoTrans: an integrated computational framework for comprehensive transcriptome analysis with Nanopore direct RNA sequencing. Journal of Genetics and Genomics. (https://doi.org/10.1016/j.jgg.2024.07.007)
  3. Xinyu Tu#, Fan Wang#, Gianni Liti, Michael Breitenbach, Jia-Xing Yue*, Jing Li* (2023) Spontaneous Mutation Rates and Spectra of Respiratory-Deficient Yeast. Biomolecules. 2023, 13, 501.
  4. Jing Li, Simon Stenberg, Jia-Xing Yue, Ekaterina Mikhalev, Dawn Thompson, Jonas Warringer, Gianni Liti* (2023) Genome instability footprint under rapamycin and hydroxyurea treatments. PLoS Genetics 19(11): e1011012.
  5. Jing Li, Bertrand Llorente, Gianni Liti*, Jia-Xing Yue* (2022) RecombineX: A generalized computational framework for automatic high-throughput gamete genotyping and tetrad-based recombination analysis. PLoS Genetics 18(5): e1010047.
  6. Jing Li, Ignacio Vázquez-García, Karl Persson, Asier González, Jia-Xing Yue, Benjamin Barré, Michael N. Hall, Anthony D. Long, Jonas Warringer, Ville Mustonen, Gianni Liti*. (2019) Shared molecular targets confer resistance over short and long evolutionary timescales. Molecular Biology and Evolution, 36(4):691-708