岳家兴
专长
姓名：岳家兴
职称：副研究员、独立PI、博士生导师、单分子测序平台主任
实验室地址：黄埔院区腾飞园F座9楼
联系方式：yuejx@sysucc.org.cn
个人主页：https://www.evomicslab.org
个人简介：
南京大学生本科（2007）及硕士（2010）。2015年获得美国莱斯大学（Rice University）博士学位，随后在法国国家科学研究中心（CNRS）从事博士后研究。2019年获中山大学“百人计划”支持加入中山大学肿瘤防治中心及华南恶性肿瘤防治全国重点实验室。2020年获得广东省“珠江人才计划”支持。其课题组（Evomics Lab）致力于针对基因组不稳定性的组学表征、演化动态、以及靶向方法的研究。迄今共发表论文40余篇，近年来以第一或通讯作者身份（含共同）在Nature Genetics（2023、2017）、Nature Protocols（2018）、Genome Research（2025）、Nucleic Acids Research（2024）、Genome Medicine（2024）等领域著名期刊上发表代表性工作。其近期研究获得了国家自然科学基金委员会和广东省自然科学基金委员会的资助。同时担任中国遗传学会青年委员会委员、Yeast期刊编委。
教育和工作经历：
2019.11-现在 副研究员，中山大学肿瘤防治中心，实验研究部
2015.06-2019.09 博士后，法国国家科学研究中心 (CNRS)，尼斯癌症与衰老研究所 (IRCAN)，合作导师：Gianni Liti
2010.08-2015.05 PhD，Rice University, Department of BioSciences，导师：Nicholas H. Putnam, Michael H. Kohn
2007.09-2010.06 硕士，南京大学，生命科学学院，导师：田大成
2003.09-2007.06 学士，南京大学，生命科学学院
研究方向：
阐明基因组不稳定性的组学表征和功能影响
解析基因组不稳定性的演化轨迹和调控机制
开发靶向基因组不稳定性关键分子特征的新技术
主要研究手段：
基因组学、实验演化、遗传学、单分子测序、生物信息学
代表性研究论文：
Total papers: 45; Total citations: 4022; h-index: 23; i10-index: 31.
(based on the Google Scholar statistics; last accessed on 2025/02/25)
Corresponding author: *, co-1st author: ^
- Zepu Miao, Jia-Xing Yue*. (2025) Interactive visualization and interpretation of pangenome graphs by linear-reference-based coordinate projection and annotation integration. Genome Research, 35(2):296-310.
- Zepu Miao^, Yifan Ren^, Andrea Tarabini^, Ludong Yang, Huihui Li, Chang Ye, Gianni Liti, Gilles Fischer, Jing Li*, Jia-Xing Yue*. (2024) ScRAPdb, an integrated pan-omics database for the Saccharomyces cerevisiae reference assembly panel. Nucleic Acids Research, 53(D1):D852-D863.
- Zegeng Chen^, He Huang^, Huangming Hong^, Huageng Huang, Huawei Weng, Le Yu, Jian Xiao, Zhao Wang, Xiaojie Fang, Yuyi Yao, Jia-Xing Yue*, Tongyu Lin*. (2024) Full-spectral genome analysis of natural killer/T cell lymphoma highlights impacts of genome instability in driving its progression. Genome Medicine, 16(1):48.
- Samuel O’Donnell^, Jia-Xing Yue^, Omar Abou Saada, Nicolas Agier, Claudia Caradec, Thomas Cokelaer, Matteo De Chiara, Stephane Delmas, Fabien Dutreux, Teo Fournier, Anne Friedrich, Etienne Kornobis, Jing Li, Zepu Miao, Lorenzo Tattini, Joseph Schacherer*, Gianni Liti*, Gilles Fischer*. (2023) Telomere-to-telomere assemblies of 142 strains characterize the genome structural landscape in Saccharomyces cerevisiae. Nature Genetics, 55(8):1390-1399.
- Jing Li, Bertrand Llorente, Gianni Liti*, Jia-Xing Yue*. (2022) RecombineX: a generalized computational framework for automatic high-throughput gamete genotyping and tetrad-based recombination analysis. PLoS Genetics, 18(5):e1010047.
- Jia-Xing Yue*, Gianni Liti*. (2019) simuG: a general-purpose genome simulator. Bioinformatics, 35(21):4442-4444.
- Jia-Xing Yue*, Gianni Liti*. (2018) Long-read sequencing data analysis for yeasts. Nature Protocols, 13(6):1213–1231.
- Jia-Xing Yue, Jing Li, Louise Aigrain, Johan Hallin, Karl Persson, Karen Oliver, Anders Bergström, Paul Coupland, Jonas Warringer, Marco Cosentino Lagomarsino, Gilles Fischer, Richard Durbin, Gianni Liti*. (2017) Contrasting evolutionary genome dynamics between domesticated and wild yeasts. Nature Genetics, 49(6):913-924.
主持的科研项目：
- 2025-2028 国家自然科学基金，面上项目，32470663
基于图形泛基因组检测结构变异的生物信息学方法的开发和应用 - 2022-2024 广东省自然科学基金，面上项目，2022A1515010717
病毒基因组整合分析软件的开发及其在鼻咽癌EB病毒研究中的应用 - 2021-2024 国家自然科学基金，面上项目，32070592
染色体异倍化对基因组不稳定性及表型适应性的演化影响的研究 - 2020-2022 广东省基础与应用基础研究基金，青年项目，2019A1515110762
用于检测基因组全谱段遗传变异的生物信息学软件的开发与应用 - 2019-2024 中山大学“百人计划”，YTP-SYSUCC-0042
